Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL9A2Q14055 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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