Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GTF2H3Q13889 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms