Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms