Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SF3B2Q13435 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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