Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
MSLNQ13421 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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MSLNQ13421 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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MSLNQ13421 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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MSLNQ13421 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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MSLNQ13421 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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MSLNQ13421 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MSLNQ13421 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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