Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
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ITGB3BPQ13352 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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ITGB3BPQ13352 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
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ITGB3BPQ13352 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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ITGB3BPQ13352 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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ITGB3BPQ13352 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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ITGB3BPQ13352 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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ITGB3BPQ13352 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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ITGB3BPQ13352 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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ITGB3BPQ13352 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ITGB3BPQ13352 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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