Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATMQ13315 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATMQ13315 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATMQ13315 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
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