Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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