Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SEMA3FQ13275 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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SEMA3FQ13275 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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SEMA3FQ13275 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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SEMA3FQ13275 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SEMA3FQ13275 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SEMA3FQ13275 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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