Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SRSF6Q13247 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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