Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
SRSF5Q13243 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SRSF5Q13243 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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