Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CHAF1AQ13111 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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