Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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PTPRBP23467 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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PTPRBP23467 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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PTPRBP23467 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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PTPRBP23467 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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PTPRBP23467 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRBP23467 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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PTPRBP23467 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
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PTPRBP23467 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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PTPRBP23467 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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PTPRBP23467 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
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PTPRBP23467 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRBP23467 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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