Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SNX13Q9Y5W8 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms