Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM7SF3Q9NS93 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms