Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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CCDC47Q96A33 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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CCDC47Q96A33 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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CCDC47Q96A33 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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CCDC47Q96A33 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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CCDC47Q96A33 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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CCDC47Q96A33 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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