Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRIM63Q969Q1 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms