Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
UBXN4Q92575 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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