Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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