Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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GEN1Q17RS7 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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GEN1Q17RS7 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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GEN1Q17RS7 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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GEN1Q17RS7 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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GEN1Q17RS7 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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GEN1Q17RS7 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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GEN1Q17RS7 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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GEN1Q17RS7 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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GEN1Q17RS7 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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GEN1Q17RS7 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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