Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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