Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FXNQ16595 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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FXNQ16595 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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FXNQ16595 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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FXNQ16595 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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FXNQ16595 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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FXNQ16595 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FXNQ16595 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
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FXNQ16595 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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FXNQ16595 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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FXNQ16595 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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FXNQ16595 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FXNQ16595 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FXNQ16595 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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FXNQ16595 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FXNQ16595 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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FXNQ16595 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FXNQ16595 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FXNQ16595 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FXNQ16595 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FXNQ16595 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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