Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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