Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK4Q16099 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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