Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
JMJD1CQ15652 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms