Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TLR1Q15399 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms