Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHD4Q14839 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms