Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMCO1Q147U7 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMCO1Q147U7 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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