Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
CACNA1CQ13936 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1CQ13936 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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