Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms