Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTCH1Q13635 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTCH1Q13635 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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