Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATRQ13535 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATRQ13535 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATRQ13535 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
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