Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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TCIRG1Q13488 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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TCIRG1Q13488 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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TCIRG1Q13488 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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TCIRG1Q13488 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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TCIRG1Q13488 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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