Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SP140Q13342 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SP140Q13342 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SP140Q13342 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SP140Q13342 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SP140Q13342 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SP140Q13342 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SP140Q13342 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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