Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1AQ13111 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms