Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRDNQ13061 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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