Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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GRIK3Q13003 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK3Q13003 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK3Q13003 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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