Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
BPTFQ12830 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BPTFQ12830 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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