Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHRNEQ04844 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms