Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPREB1P12018 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms