Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERVV-1B6SEH8 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERVV-1B6SEH8 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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