Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms