Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
EHD3Q9NZN3 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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