Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXQ1Q9C009 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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