Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ZBED3Q96IU2 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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