Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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