Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CDO1Q16878 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CDO1Q16878 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CDO1Q16878 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms