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| UPP1 | Q16831 | SNORD114-30-201 | ENST00000364448 | 72 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AKAP14-203 | ENST00000371425 | 793 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-217P-201 | ENST00000384164 | 104 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA70B-201 | ENST00000384210 | 135 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1035P-201 | ENST00000384477 | 107 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA41-201 | ENST00000384675 | 132 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-780P-201 | ENST00000391030 | 104 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTCO3P40-201 | ENST00000392516 | 676 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | CISD1P1-201 | ENST00000393907 | 327 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | CALM2P3-201 | ENST00000400429 | 449 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL591416.1-201 | ENST00000404015 | 867 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | Z98742.3-201 | ENST00000418637 | 326 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL356134.1-201 | ENST00000419815 | 373 nt | TSL 3 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL136322.1-201 | ENST00000422250 | 548 nt | TSL 4 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | HMGN2P30-201 | ENST00000423237 | 256 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | ELOCP14-201 | ENST00000428070 | 331 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL36AP53-201 | ENST00000432891 | 316 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL36AP6-201 | ENST00000435770 | 321 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC007879.3-202 | ENST00000448786 | 823 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL39P36-201 | ENST00000490784 | 156 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SUMO2P6-201 | ENST00000505273 | 288 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-314P-201 | ENST00000516574 | 104 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | SKP1-203 | ENST00000517625 | 876 nt | APPRIS P4 TSL 3 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC100763.1-201 | ENST00000532735 | 522 nt | TSL 3 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL359212.1-201 | ENST00000556608 | 614 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC019183.1-201 | ENST00000580524 | 505 nt | TSL 3 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC01897-203 | ENST00000591503 | 369 nt | TSL 2 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC004805.2-201 | ENST00000605382 | 482 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC139792.3-201 | ENST00000623525 | 224 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC073308.1-201 | ENST00000623696 | 305 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC068631.1-221 | ENST00000626006 | 592 nt | TSL 5 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | PSMD5-AS1-215 | ENST00000640622 | 205 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SLC39A10-201 | ENST00000359634 | 5322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | NOX4-202 | ENST00000343727 | 3347 nt | TSL 2 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1120P-201 | ENST00000362988 | 108 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU4-48P-201 | ENST00000365559 | 182 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.372-201 | ENST00000365599 | 102 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.576-201 | ENST00000384781 | 102 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-192P-201 | ENST00000391253 | 100 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL162578.1-201 | ENST00000406202 | 378 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AF274854.1-201 | ENST00000413236 | 615 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | UBE2V1P10-201 | ENST00000414685 | 269 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC099548.1-201 | ENST00000421443 | 426 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC00844-201 | ENST00000432535 | 477 nt | TSL 2 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | DENND4A-202 | ENST00000443035 | 8665 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | GSTA11P-201 | ENST00000452866 | 669 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | FABP5P15-201 | ENST00000453566 | 214 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | NDUFAF4P4-201 | ENST00000454883 | 502 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC01038-201 | ENST00000457858 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | snoU13.28-201 | ENST00000459235 | 104 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC02377-201 | ENST00000500169 | 450 nt | TSL 3 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | ANXA2P1-201 | ENST00000505539 | 926 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP165-201 | ENST00000517142 | 115 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP001893.2-201 | ENST00000526949 | 202 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC007368.1-201 | ENST00000536422 | 974 nt | TSL 5 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | ELOCP31-201 | ENST00000540463 | 467 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | CASC1-205 | ENST00000545133 | 2146 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC025575.1-201 | ENST00000548497 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | ADI1P3-201 | ENST00000549509 | 470 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | G2E3-AS1-204 | ENST00000552511 | 402 nt | TSL 2 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC008521.1-201 | ENST00000587471 | 187 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC078899.3-201 | ENST00000599065 | 212 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC012507.3-201 | ENST00000603556 | 477 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AL021997.1-201 | ENST00000605757 | 193 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC004492.1-201 | ENST00000607036 | 742 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AL589740.1-207 | ENST00000607823 | 1962 nt | TSL 5 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC092954.2-201 | ENST00000609103 | 430 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC013562.2-201 | ENST00000611632 | 603 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC122108.2-201 | ENST00000611946 | 526 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | C8orf59-208 | ENST00000612809 | 475 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC073534.2-201 | ENST00000620377 | 381 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL359880.1-201 | ENST00000621879 | 266 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | OR4C16-201 | ENST00000623907 | 933 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR6733-201 | ENST00000635723 | 61 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | U6.114-201 | ENST00000636407 | 96 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MACC1-202 | ENST00000400331 | 9159 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | TECRL-202 | ENST00000507440 | 2876 nt | TSL 5 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF117-204 | ENST00000620222 | 5317 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MLF1-203 | ENST00000392822 | 2157 nt | TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | EVI2A-201 | ENST00000247270 | 1860 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTND5P17-201 | ENST00000418405 | 1603 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AGL-204 | ENST00000370161 | 6923 nt | TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | HSPA4L-202 | ENST00000505726 | 2639 nt | TSL 2 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD115-7-201 | ENST00000365306 | 82 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1029P-201 | ENST00000384109 | 107 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.505-201 | ENST00000384489 | 102 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.534-201 | ENST00000384599 | 112 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | TRAV41-201 | ENST00000390468 | 336 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA26.7-201 | ENST00000391288 | 122 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6ATAC16P-201 | ENST00000408591 | 138 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC093157.2-201 | ENST00000414686 | 671 nt | TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |