Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTN1Q16799 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RTN1Q16799 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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