Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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CTF1Q16619 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CTF1Q16619 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CTF1Q16619 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CTF1Q16619 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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CTF1Q16619 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CTF1Q16619 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CTF1Q16619 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CTF1Q16619 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CTF1Q16619 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CTF1Q16619 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CTF1Q16619 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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